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猪流行性腹泻病毒（PEDV）属冠状病毒科α冠状病毒属。该病原被发现于20世纪70年代，自发现以来多次呈地方和全球流行。自2010年以来，该病毒在我国生猪产业广泛爆发，持续流行传播至今，造成了大量仔猪死亡，给我国养猪业带来了巨大的经济损失。因此，深入研究PEDV在我国和世界的流行演化规律，对疾病的防控和疫苗的开发具有重要意义。
中山大学曹永长教授团队一直密切关注PEDV在我国的流行传播，与温氏集团，温氏研究院，江苏省农科院等单位密切合作， 长期监测PEDV在我国的临床发病情况，共收集2011-2021年间 PEDV阳性病料149869份，分离并测序65株PEDV全基因组序列。课题组进一步通过生物信息学，分子生物学等手段对PEDV在中国及世界的流行传播规律进行了深入分析。
PEDV在2011-2021我国的流行传播
工作以“Global dynamics of porcine enteric coronavirus PEDV epidemiology, evolution and transmission”为题，于2023年3月在遗传学一区TOP期刊MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION（IF=16.2）发表。论文首次阐明PEDV基于单倍型分析在世界的分型，并且发现商品化疫苗的使用，可能加快了PEDV的进化速率，并且进一步发现了能够识别PEDV不同毒株分型的特异性表位。该研究对冠状病毒流行演化机制的阐明具有重要的科学意义（Zhang et al., Mol Biol Evol, 2023）。
PEDV单倍型分析
该研究受到十四五，十三五国家重点研发计划资助，张灏特聘副研究员为论文的第一作者，曹永长教授为唯一通讯作者，邹创超博士和彭欧阳博士对数据处理工作提供了重要支撑，斯坦福大学Usama博士和孙逸仙纪念医院医学研究中心徐秋萍助理研究员为论文撰写提供了重要帮助，团队其他老师为研究工作提供了重要支持，温氏集团和江苏省农科院的合作者为研究工作提供了大力支持， 吴仲义 教授为论文进行了重要指导。
论文链接：https://doi.org/10.1093/molbev/msad052
来源：病毒学界
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